分析新冠病毒基因组突变为了解病毒的适应和进化提供线索

医牛资讯原创 2020-05-20 新型冠状病毒|COVID-19|基因突变 (2367)

一个由伦敦大学学院(UCL)领导的研究小组通过分析来自7500多名COVID-19(新型冠状病毒病)感染者的病毒基因组,已经确定了新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组的多样性模式,为指导药物和疫苗靶点提供了线索。该研究发现了病毒中近200个反复发生的基因突变,并强调了病毒可能如何适应和进化到人类宿主。

最新发表在国际著名医学期刊《感染、遗传和进化》(Infection, Genetics and Evolution)杂志上的这项研究结果还进一步证实,这种病毒是在2019年末才出现的,之后才迅速在全球传播开来。科学家们分析了新型冠状病毒SARS-CoV-2的基因组多样性的出现,他们筛查了全球感染患者的逾7500种病毒的基因组。SARS-CoV-2是一种导致Covid-19的新型冠状病毒。他们确定了198个突变,这些突变似乎是独立地发生了不止一次,这可能为病毒如何适应提供了线索。

该研究的共同作者、伦敦大学学院遗传学研究所的弗朗索瓦·巴洛克斯教授表示: “所有的病毒都会自然变异。突变本身并不是一件坏事,没有任何证据表明SARS-CoV-2突变的速度快于或慢于预期。到目前为止,我们还不能确定SARS-CoV-2的致命性和传染性是否有所减弱。”

这些微小的基因变化或突变并没有均匀地分布在整个病毒基因组中。研究人员认为,由于基因组的某些部分很少发生突变,病毒中那些不变的部分可能成为药物和疫苗开发的更好目标。

巴洛克斯教授解释说:“战胜病毒的一个主要挑战是,如果病毒发生变异,疫苗或药物可能不再有效。如果我们把精力集中在病毒中不易变异的部分,我们就有更好的机会开发出长期有效的药物,”

该研究小组已经开发了一种新的交互式、开源的在线应用程序,这样全球的研究人员也可以审查病毒基因组,并应用类似的方法来更好地理解病毒的进化。

这项研究是由伦敦大学学院生命科学和医学学院的研究人员,以及Cirad and Université de la Réunion大学、牛津大学和伦敦帝国理工学院的同事们共同完成的,并得到了英国牛顿基金中国自然科学基金和生物技术与生物科学研究委员会(BBSRC)的支持。


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